混沌未分天地亂，茫茫渺渺無人見。自從盤古破鴻蒙，開闢從茲清濁辨。覆載群生仰至仁，發明萬物皆成善。欲知造化會元功，須看《西遊釋厄傳》。
天地之數，有十二萬九千六百歲為一元。將一元分為十二會，乃子、丑、寅、卯、辰、巳、午、未、申、酉、戌、亥之十二支，每會該一萬八百歲。天地以一元為一個周期，一個周期有十二萬九千六百年，從黑暗到光明再到黑暗，生物從產生再到消亡。故事就發生在無數個周期中的一個，被稱作西遊世界。
西遊世界前五千四百年，一團黑暗，稱為混沌。又過了五千四百年逐漸開明，天始有根。再五千四百年清氣上騰，有日月星辰，謂之四象。又經五千四百年，始成大地，再五千四百年，重濁下凝，有水火山石土，謂之五形。又經五千四百年，天氣下降，地氣上升，天地交合，群物皆生。群物值得是樹木花草，再五千四百年生人，生獸，生禽，正謂天地人，三才定位，至此西遊世界成。
西遊世界從周期開始到人類萬物產生一共用了6個五千四百年合計32400年。天地生群物的交合方式是平面相交，隨著天氣下降的高度越來越少，地氣上升的高度也越來越少，最後能夠得到交合之氣的就是地上的最高峰——天柱也就是後來的花果山，換句話說天柱就是天地的生殖器，天地第一次在花果山頂交合，摩擦的落土，因為得到交合之氣形成了上古的人類，第二次交合生走獸，最後一次交合生飛禽。自此天地再也沒有交合，天高從此地遠。
人類以盤古為首，走獸以麒麟為長，飛禽以鳳凰為長。萬物和人類都住在天柱周圍，隨著人類和萬物的繁殖，西遊世界的第一個矛盾就產生了，人類和萬物的生存空間之爭。為了爭奪生存空間，人類和走獸、飛禽決裂。更為了爭奪天柱的控制權，和西遊世界的領導權，萬物和人類展開了曠日持久的萬物之戰。
戰鬥的第一階段，人類先下手為強，憑藉作為天地交合最早的產物，擁有著先天優勢，對萬物進行偷襲，萬物準備不足，人類把萬物成功趕出了生命的發源地天柱。
戰鬥的第二階段，面對人類的咄咄逼人，麒麟和鳳凰決定在萬壽（獸）山，集結全部戰力，要和人類決一死戰。為了爭取更多的準備時間，蛇盤山鷹愁澗、黑風山黑風洞、黃風山黃風洞、流沙河四個關卡負責拖延人類的進軍步伐。深林鷹鳳聚千禽，古洞麒麟轄萬獸，萬壽山一場大戰，留下累累白骨天地生成最早的人類死了不計其數，只要能活下來的最後都成長為後來的人類大神，其中有一個叫鎮元子的年輕人被留下來守墳，他在白骨之上種了一棵樹，這就是後來的人參果。
戰鬥的第三階段，萬物戰敗向西退卻，人類緊追不放，白虎嶺一站老虎之首白虎戰死，所以西遊世界沒有出現頂級的大神級老虎，寶象國的首領大象、烏雞國的毗藍婆家族、枯松澗、黑水河、通天河都沒能攔住人類的腳步，特別是黑水河一站，河水從清邊紅，從紅變紫，最後變黑，已經不是血流成河，二是血流成黑了。在萬物的逃亡過程中，有一隻鳳凰墜落落鳳坡，無奈之下與鳥中至賤花鴇交合生下孔雀、大鵬，最後被人類剿殺，孔雀、大鵬最好吃人，乃是抱殺母之仇。因為這個偶然萬物終於找到可以對抗人類的方法就是創造新的物種，鳳凰和麒麟開始進行大規模的配種，人類的大軍包圍了麒麟山，麒麟不願親眼看自己的兄弟戰死，也不想再逃，更為了掩護鳳凰，決心在麒麟山與人類最後一戰，結果世界再無麒麟，麒麟滅種。
戰鬥的第四階段，剩下的萬物達成共識一定要保證已經懷孕鳳凰的安全，等待萬物新一代領袖的誕生，在盤絲嶺、獅駝嶺、黑松林、隱霧山、豹頭山、竹節山拼死抵抗，而這一些列戰鬥的領袖就是九頭獅子九靈元聖，上通三聖，下徹九泉也絕非虛名，九靈元聖的竹節山為什麼叫竹節？就是暗示在九曲盤桓洞內，利用地形優勢，九靈元聖節節抵抗，寸土必爭。但是無奈實力懸殊最終被人類團團包圍，不忍受辱正要自殺，突然遠處西方一聲霹靂，隨後天崩地裂、電閃雷鳴，他知道萬物的希望來了，萬物的領袖來了，放棄自殺被人類活捉，直到今天九靈元聖仍然沒有放棄，他相信總有一天他會重獲自由，終會有一天萬物會重新奪回這個世界。
西遊世界的第一場戰役——萬物之戰在一聲霹靂之中結束了，人類取得了對萬物的完勝，萬物領袖麒麟戰死，人類更取得了對天柱的所有權，人類站到了西遊世界權力的頂峰，通過萬物之戰更發現了這個世界除了天柱所在的島嶼，還有更廣闊的陸地，這是一場戰爭，更是一場地理大發現。在戰鬥中，人類開始形成了管理層級，以居住天柱的位置，從下到上分成三層，上八洞三清、四帝、太乙天仙等眾；中八洞玉皇、九壘、海岳神仙；下八洞幽冥教主，注世地仙。站在天柱頂峰的就是引領萬物之戰的盤古大神。
一聲霹靂，一場天崩地裂之後，鳳凰在牛族的拱衛之下，在青龍山產下了——祖龍，擁有著鳳凰和麒麟的雙重血統，他是當之無愧萬物新一代的領袖，但是祖龍的數量太少而且年幼，萬物最後的戰力選擇帶著龍種繼續向西撤離，最終來到靈山落腳，而此時自以為大獲全勝的人類軍團，並沒有勝利的喜悅，因為他們發現了比戰爭更可怕的事情，離開天柱之後，他們在不斷的衰老，他們發現自己的皮膚開始乾癟，頭髮褪去了顏色，他們陷入了前所未有的恐慌，比萬物更可怕的是死亡，他們正在喪失不老不死的能力，他們不得不重回天柱，找尋返老還童、延續生命的方法，只好暫停了進攻的步伐。
遠在靈山的祖龍獲得了喘息的時間，他們不斷的繁殖，來增加龍族的數量，於是第一代龍生龍產生，可是這畢竟太慢，對抗茫茫的人類軍團，簡直不堪一擊，終於他們發現了一條捷徑——萬物化龍。在靈山，祖龍們通過龍尿的方式構建了化龍池，凡入龍池者皆可成龍。一直保衛祖龍的牛族成為第一批龍尿龍，如今掌管四海的敖家兄弟就在其中。偉大的龍族誕生了，龍族終於開始了蓄謀已久的復仇。
準備好一切的龍族在西方組建了強大的軍團，他們向人類宣戰，從西開始進軍，人類遇到了從來沒有見過的物種，見到了前所未有的戰鬥力，人類節節敗退。龍族的凱歌之中，也隱隱藏著不安的因素，龍族分成三層，祖龍、龍生龍、龍尿龍，根據血統的純潔程度，形成了金字塔形權力結構，底層數量龐大的龍尿龍備受壓榨，憤怒不滿在積累，而祖龍們卻已經被勝利沖昏了頭腦。龍族內部的分裂和矛盾很快被人類發現並且利用，他們和龍尿龍中的領頭人敖家達成了協議，約定雙方共同消滅真龍，天地一分為二，在最終決戰來臨之前，龍尿龍選擇背叛了龍族。
敖家給祖龍提供了人類軍團在平頂山的假情報，可以一舉消滅人類，祖龍把真龍的全部戰力投入到了平頂山，哪裡知道這是一個滅亡龍族的致命圈套，人類要用平頂山的土活埋龍族。戰鬥打響不久，祖龍才發現這是一個陷阱，並且龍尿龍開始退出戰場，祖龍、龍生龍陷入了層層包圍，從天空中開始降下石頭黃土，真龍血統就要被活埋，眼看大勢已去，真龍不甘心受辱，隨著祖龍的一聲令下，群龍騰空，用身體撞向天際，真龍選擇了自殺，他們要把天地毀掉，他們要和人類同歸於盡，群龍的身體墜落被黃土掩埋，他們被埋之地被稱為壓龍山，平頂山頂平就是因為壓龍。最後一隻祖龍，看到此番場景不禁淚落，用盡全身的氣力大吼一聲，沖向天空，在一次又一次撞擊之下，龍頭滴血，天再也承受不住，一條縫隙從西北裂向東南，天終於塌了。天地瞬間失色，陰雲密布，黑氣席捲整個寰宇，海波翻騰，整個世界眼下就要毀於一旦。
人類的領袖盤古再一次站了出來，唯一能拯救這個世界的方法就是補天，他讓自己的助手到崑崙山頂，打造了一根人造天柱，支撐起天，使天不在墜落。隨後他來到天柱的頂峰，建起一座八卦爐，他要鍊石補天。而補天的材料就是花果山頂的交合之土，這些土本來可以化成生靈，卻再也沒有機會了。交合之土被練成了補天石，盤古從天柱一直補到崑崙山，終於天被補好了，但是天柱再也不接天了。崑崙上頂的人造天柱就是後來的金箍棒，老祖鍊石補天煽火的扇子就是芭蕉扇。
天地之間的危機終於解決了，很快人類便違背了和龍尿龍的協約，沒有什麼天地一分為二，要麼死要麼臣服，敖家一族最終選擇了臣服，淪為了捕殺龍的急先鋒，而這些龍肉都上了人類眾神的餐桌。同時人類在補天石之上建起了最早的天宮，盤古因為他在萬物之戰、人龍之戰和補天的三大功績，被尊稱為太上老祖，成為天地之間至高無上，獨一無二的神，他補天的助手被稱為太上老君。人類一統了天地，但是更大更可怕的敵人終於站到了他們的面前：死亡。
人類戰勝了萬物贏得了空間，但是人類迎來了更恐怖的敵人—時間。沒有了時間就是死亡，人類終於意識到生命不是無限的，人類回到天柱，找到生命的真相-交合之氣。生命的誕生來自交合之氣，而延續生命同樣需要交合之氣。但是天地的距離越來越遠，最後僅存的天柱也因為龍的毀天滅地而被老祖用來鍊石補天。天地再也不能交合，交合之氣不再產生，真龍把天撞塌，更使原本不多的交合之氣大量的泄漏，這個效果就像氣球撒氣一樣，沒有了交合之氣，人就會死。可以做這麼一個比喻，補天石其實就是氣球的一個補丁，要時時刻刻防止漏氣。
人類陷入了前所未有的恐懼之中，他們畏懼死亡，和萬物戰死是可以控制的是一種榮譽而現在的死亡是必然的，是毫無意義的，沒有人可以逃避的。但是並不意味著人類就此放棄了對長生的需求，人類出現了對於死亡態度的兩個派別：一個是太上老祖主張的自然派，一切都交給天命。一個是太上老君為代表的修行派，後來發展成道教，他們研究交合之氣，一定能找到獲得交合之氣的方法，各種長生實驗雨後春筍的秘密開展起來，很快根據實驗的結果發展出了一個新的派別剝奪派。如果交合之氣不能自己產生，那麼我們可以去將別人的交合之氣奪為己有。那麼如何搶奪呢？吃人肉。開始的時候人類吃萬物肉後來吃龍肉，然而人類很快發現人肉的效果是最好的，獲得的交合之氣也最多。
人龍之戰不久之後，人類為了奪取交合之氣陷入了自相殘殺，一切看起來都不可逆轉，直到有一個人中八洞的玉皇拿出了蟠桃，在老祖鏈石補天的時候，玉皇私藏了一部分交合之土，並且交給後來的王母，王母在交合之土上種出了蟠桃。交合之土內含交合之氣，結出來的果子自然也有交合之氣，這和萬壽山的人參果是一個道理，人類萬物的屍骨化成了同樣具有交合之氣的土壤。蟠桃的橫空出世，讓人類終於不再自相殘殺，原本中八洞玉皇的地位火箭般的躥升。
太上老祖是自然派的代表，他無法接受人類對時間的篡改，他認為人類追求長生是個致命的錯誤，在他的眼裡蟠桃的誕生就是個罪惡，他對所有的人類神仙宣布：長生是非法的，服用長生藥就是罪惡。人類眼看永生不死的靈藥蟠桃就在眼前，怎麼可能會聽從太上老祖的規勸。
為了毀掉蟠桃，老祖釋放了十隻金烏，也就是太陽，炙烤大地。蟠桃樹眼瞅著就要被活活曬死，人類軍團赫赫有名的先鋒，后羿拿起自己的弓箭，九烏墜地，留下一個作為世間的燈塔。后羿成為了人類的救星，他和玉皇並列成為人類眾神的領袖。同時人類眾神再也不能容忍盤古對長生的破壞和阻攔，盤古必須死，他們撤銷了盤古太上老祖的封號，高喊：吃蟠桃得永生，殺盤古得太平，殺向了天宮，可是人類眾神在第一輪的交鋒中沒有戰勝盤古，那麼誰能夠殺死盤古呢？誰殺死了盤古，誰就是人類至高無尚的神。后羿站了出來，他要去刺殺盤古，為了更方便的接近盤古，后羿要改頭換面奪舍投胎。
此時的太上老君還隱藏著自己的身份，留在盤古的身邊，盤古也根本不知道自己最親愛的戰友老君居然才是他最大的敵人，老君偷偷從崑崙山拿回天柱，並取其中最好的材質打造了九尺釘鈀，約定后羿奪舍成功之後，拿著九尺釘鈀拍死盤古。但是有一個人不能容忍后羿的成功，他就是蟠桃的主人——玉皇，他要做至高無尚的人類領袖。而后羿奪舍投胎之時就是除掉后羿的最好機會，他首先毀了后羿的肉身，隨後又毀了后羿投胎的身體，后羿不能在有限的時間內投胎就會灰飛煙滅，后羿在最後一刻只好錯投豬胎，靈魂就此沉睡，成為一頭野豬流落下方。
后羿始終沒有出現，但是人類已經沒有那麼多的時間等待，於是玉皇以談判的名義邀請盤古赴宴，盤古太過於自信了，他帶著老君去了，在酒席宴上人類突然發難，向盤古發動進攻，盤古有萬夫不當之勇，但是他萬萬沒想到老君一劍刺穿了他的胸膛，他曾經最親密的助手，最好的戰友背後捅了他一刀，盤古絕望的回頭：是你。龐大的身軀倒地，化作一縷白煙。
人類戰勝了盤古，蟠桃的主人玉皇被尊為上帝，也就是玉皇大帝，老君成為道祖，取代了太上老祖的地位。為了蟠桃的安全，玉帝將交合之土和蟠桃都搬上了天宮，修了蟠桃園。長生是合法的，沒有任何人可以阻礙人類追求長生了，神仙的世界終於形成，但是盤古他真的死了嗎？他又去哪了？一場新的大戰正在醞釀之中。
盤古並沒有死，他的肉身被毀，自己的一靈真性四處飄蕩，來到一處山嶺，後來被稱為荊棘嶺，寄居於一顆菩提樹上，久而久之樹化人形，菩提老祖誕生。菩提老祖有盤古之魂，沒有盤古的身軀就喪失了曠古絕今的戰力，他要想戰勝現在的天庭，只有一個方案就是組建一支完全屬於自己的軍團。
第一步，菩提祖師首先召集忠誠於自己的部下，以及在天庭中不得勢的邊緣力量，其中有後來的燃燈古佛、如來、觀音等。
第二步，菩提祖師拉攏戰敗之後四處逃難的萬物將領，其中就有毗藍婆、青毛獅子、大象等。
將兩股勢力合併組建了西方教，自己就是教主，他們的老師，但是這些力量遠遠不足以抗衡如日中天的人類眾神，而且經受背叛的菩提祖師也並不信任他們，菩提只交給他們一個任務就是收集自開天闢地以來戰死的人類和萬物的魂魄。至於報酬，菩提許諾會給所有追隨自己的人類和萬物永生，那麼如何永生呢？
菩提將收集到的魂魄注入樹中造就了最早的一批樹人，人變成樹木就可以得到永生，因為樹木可以紮根於地向天而生，可以自產交合之氣，用現在科學的說法叫光合作用。盤古以菩提樹的根莖關聯了所有的樹人，每個樹人的想法，他都能第一時間的獲得，他可以直接控制每個樹人的一舉一動，這樣就再也不會有背叛了。跟隨盤古的西方教很快就意識到了菩提的目的，菩提只給他們提供了一條路就是成為樹人，徹底喪失自我意識，成為菩提操控的棋子。他們必須在長生和自由之中做一個選擇，究竟要不要成為不死的植物人喪屍五感。如來解決的反對成為樹人，他說：不自由毋寧死，我們是人不是樹。很快西方教達成了共識並且立刻派人和天庭談判，並且透露了菩提祖師的所有計劃，菩提就是盤古他是這個世界最恐怖的敵人。樹人軍團在沒日沒夜的生產，人類必需立刻行動，天庭出動所有的戰力，西方教會從內部響應。
菩提再一次被出賣了，第一次因為他的信任，第二次因為他的不信任，他的大樹軍團還沒有形成，可是人類眾神已經團團包圍了荊棘嶺，樹人和眾神大戰，樹人雖少但是依舊展現了人類所不具有的能力，無知無畏無痛無感，人類並不占優勢，戰鬥就在焦灼之時，西方教中年輕領袖如來很快就發現了樹人軍團的致命弱點，只要切斷菩提祖師和樹人的關聯，樹人軍團自然陷入崩潰，如來帶著西方教圍攻菩提，切斷了菩提的樹根，樹人軍團瞬間潰散，人類眾神放起大火，尚未成長起來的數族就這麼滅亡了。此時菩提祖師身邊還有十八公等幾個樹人、還有與人類仇恨最深的萬物領袖，他們被重重包圍，老君走到最前：哥哥罷手吧，你沒有機會了。菩提祖師一聲長嘆：念在戰友情分，我願自裁，但是請留下我身邊人的活路。老君默許，菩提，化成九顆舍利子，分散四方。老君遵從了約定，讓西方教在菩提之處建起一座廟宇祭祀他們的師父，留下樹仙守墳。至於跟隨菩提的萬物將領獅子等，就交給西方教處理，他們都淪為佛祖菩薩的坐騎，不過保全了性命。
這場大戰被稱為第二次仙界大戰又稱樹人之戰，長生之戰盤古身死，樹人之戰盤古魂死。因為時間關係，盤古的收集到的魂魄只有少數成為樹人，魂魄也納入了天庭的管理，成立了地府，並且分門別類繪製了生死簿，但是西方教卻隱藏了一個天大的秘密就是他們還收集了龍魂，並且提前轉移。根據如來和老君的協議，西方教改稱為佛教，天庭承認佛教的合法地位，這就是化胡為佛。老君為佛教選派了一位領導彌勒佛又稱東來佛祖，如來只做了佛老。儘管如此老君仍然不放心如來，因為他太有野心了，老君把如來流放到崑崙山，保證佛教不能對道教產生任何威脅。天地重獲和平，但是新的矛盾又產生了，人類贏得了空間，奪得了時間，但是這些如何分配呢？為了爭奪分配權，一場新的博弈已然開始。
